Una de las regiones más afectada por el COVID-19 en Brasil es el estado de Amazonas que enfrentó dos oleadas de crecimiento exponencial a finales del 2020. Por ello, un equipo de trabajo de la Fundación Oswaldo Cruz de Manaos realizó un estudio en epidemiología genómica basado en 250 genomas de SARS-CoV-2 de diferentes municipios de la región muestreados entre marzo de 2020 y enero de 2021.
En la primera fase se determinó que el crecimiento exponencial fue impulsado principalmente por la difusión de una determinada variante con linaje B.1.195 que fue reemplazado gradualmente por el linaje B.1.1.28 de la variante P.1.
Sin embargo, la segunda ola coincide con la aparición de la variante P.1, que evolucionó a fines de noviembre y reemplazó rápidamente al primer linaje en menos de dos meses.
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El presente estudio es la investigación genómica del SARS-CoV-2 más completa realizada hasta la fecha en Amazonas. Su análisis final permitió conocer que la mayoría de los casos amazónicos fueron impulsados por la dispersión de algunas ramificaciones virales locales que en conjunto comprenden el 77% de los 250 genomas amazónicos del SARS-CoV-2.
Los investigadores sostienen que se podría haber reducido significativamente la transmisión de las variantes del SARS-COV-2 amazónico a otras regiones brasileñas.
Sin embargo, cuando las medidas de moderación se relajaron y el índice de distanciamiento social cayó por debajo del 40% en septiembre de 2020, los linajes mencionados al inicio se extinguieron reemplazando a una nueva variante.
El 76% de la población de Manaos se infectó a mediados de octubre del año pasado, según un estudio de donantes de sangre, sugiriendo que ya se había alcanzado la inmunidad colectiva. Pero, una segunda ola de COVID-19 los sorprendió muy pronto ocasionando el colapso del sistema de salud en Manaus entre el fin del año o el siguiente.
“Nuestros hallazgos apoyan que las intervenciones no farmacéuticas (NPI) podrían explicar una gran parte de la dinámica de la epidemia en Amazonas. La evidencia indica que la primera ola epidémica en Amazonas fue controlada relativamente por la implementación de las NPI, antes de la inmunidad colectiva. Nuestros resultados también confirman que las NPI no fueron lo suficientemente estrictas para reducir consistentemente la Re de linajes amazónicos del SARS-CoV-2 y que se mantuvo un estado estacionario de transmisión comunitaria endémica de mayo a septiembre pasados” ,afirma el autor principal de la investigación, Felipe Naveca.
De una forma más sencilla de entender, los expertos explican que el nivel de ARN del SARS-CoV-2 fue 10 veces mayor que el nivel detectado en infecciones no P.1; lo que sugiere que las personas adultas infectadas con P.1 son más infecciosas que las que albergan virus que no lo son.
Con la falta de distanciamiento social y otras medidas que no se respetaron, probablemente se aceleró la transmisión temprana de VOC P.1, mientras que la alta transmisibilidad de este impulsó aún más el rápido aumento de casos de SARS-CoV-2 y hospitalizaciones observadas en Manaos después de su aparición. Sin embargo, las medidas de mitigación eficientes, combinadas con la vacunación masiva, será crucial para controlar la propagación de nuevas variantes en Brasil.